Ngay từ khi bắt đầu, tổ chức này đã thể hiện rõ chức năng của mình là chống lại những thế lực hắc ám, trong suốt thời kì hùng mạnh của Voldemort (thập niên 1970). Tổ chức này quy tụ rất nhiều pháp sư và phù thủy tài năng, có cả những Squib. Sau sự suy tàn của Chúa tể Voldemort, tổ chức đã tạm thời giải tán. Nhưng với sự trở lại của hắn trong phần bốn, việc cần thiết là cải tổ lại tổ chức để chuẩn bị đối đầu với một cuộc chiến mới. Một số thành viên cũ được phân công trở lại (bao gồm Sirius Black, Remus Lupin và Alastor Moody), cùng với số đông thành viên mới được bổ sung thêm.

Hội đặt tổng hành dinh tại nhà Số 12, Quảng trường Grimmauld, Luân Đôn, cách Ngã Tư Vua khoảng một dặm. Nơi đây vốn là nhà của dòng họ Black mà chủ sở hữu cuối cùng của dòng họ này là Sirius Black. Sau này, trước khi chết, Sirius đã để lại quyền thừa kế cho đứa con đỡ đầu là Harry Potter. Giáo sư Dumbledore là Người-giữ-bí-mật cho Hội, nghĩa là chỉ có ông mới có quyền tiết lộ về vị trí của tổng hành dinh. Sau cái chết của ông, những người nào biết về nơi này đều trở thành Người-giữ-bí-mật, có quyền nói cho những ai mà họ muốn. Việc giáo sư Severus Snape - thành viên của hội - cũng biết nơi này, lại bị cho là kẻ phản bội, theo phe của Voldemort nên khả năng nơi này đã bị lộ là rất cao, thế nên ngôi nhà bị bỏ hoang. Về sau, trang trại Hang Chồn của nhà Weasley được chọn làm tổng hành dinh mới.

Xuyên suốt từ phần bốn đến phần bảy, Hội Phượng hoàng là một tổ chức lớn mạnh, ra mặt chống lại những thế lực Hắc ám. Mặc dù Bộ Pháp thuật từ chối không tin vào sự trở lại của Voldemort nhưng cuối cùng cũng bị Voldemort thôn tính, trở mặt chống lại Hội. Trong phần năm, những thành viên trong Hội cũng có mặt tại Sở Bảo mật để cùng một nhóm trong Đội quân Dumbledore chiến đấu với nhóm Tử Thần Thực Tử. Một lần khác, trong phần sáu, họ cũng đến trong đêm tiếp ứng cho những thành viên trong trường Hogwarts vì lý do giống như trên. Trong phần bảy, những thành viên vẫn tiếp tục công việc của mình, và một trong những nhiệm vụ và cũng là thử thách khó khăn của các thành viên trong Hội là hộ tống Harry Potter (lúc này đã đến tuổi trưởng thành) đến tổng hành dinh mới là trang trại Hang Chồn. Khi đó một nửa Bộ Pháp thuật đã bị chiếm bởi Voldemort và các Tử Thần Thực Tử luôn canh chừng Harry. Không rõ sau cái chết của Voldemort và kết thúc Cuộc chiến Hogwarts, Hội Phượng hoàng vẫn tiếp tục hay không hay lại tiếp túc tạm thời giải tán như lần trước đó.

Mặc dù giáo sư Albus Dumbledore và một vài thành viên trước kia của Hội cho rằng Voldemort đã trở lại, nhân viên của Bộ Pháp thuật và đặc biệt là Bộ trưởng Cornelius Fudge vẫn không nghe theo. Fudge tin rằng giáo sư Dumbledore đang lan truyền tin đồn này với ý định lật đổ ông ta, bởi vì sự nổi tiếng của Dumbledore trong công chúng và những lời phê bình chỉ trích từ sự quản lý tồi tệ của ông ta trong những năm qua. Tuy nhiên, cuối cùng thì lời nói của giáo sư Dumbledore cũng được chứng minh là đúng khi Chúa tể Voldemort đã được nhìn thấy tại trung tâm của Bộ Pháp thuật và Fudge phải thú nhận sự thật đó. Vì việc loan tin tức sai với ý chống lại giáo sư Dumbledore và Harry Potter, gây nên tổn thất cho bộ nên cuối cùng Fudge bị thay thế bởi Rufus Scrimgeour - trước là Giám đốc Sở Thần sáng - ba ngày trước khi bắt đầu phần sáu của bộ truyện này.